数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)NL334品系gpa-2(pk16)V基因突变体的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的行为特征,包含实验参数、视频跟踪数据及特征提取结果,可用于研究gpa-2基因对秀丽隐杆线虫行为的调控作用。
文件详解
- 特征文件(Features file)
- 文件名称:gpa-2 (pk16)V on food L_2010_02_26__10_22_2916_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,具体字段未明确说明,推测包含运动轨迹、身体姿态等由tierpsy软件提取的行为特征参数。
- 行为数据文件(Behavior data file)
- 文件名称:gpa-2 (pk16)V on food L_2010_02_26__10_22_2916.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的核心数据,具体字段未明确说明,推测包含视频帧对应的线虫行为原始记录及处理后的结构化数据。
- 行为数据压缩包(Behavior data archive)
- 文件名称:gpa-2 (pk16)V on food L_2010_02_26__10_22_2916.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含wcon格式的线虫行为数据压缩文件,wcon格式通常用于存储线虫行为的时间序列数据,如位置、速度、弯曲度等参数。
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析gpa-2基因对秀丽隐杆线虫运动行为、觅食行为等的调控机制。
- 模式生物行为学分析: 利用视频跟踪数据研究线虫在特定环境条件下的行为模式及特征。
- 神经生物学研究: 结合gpa-2基因功能,探究其在秀丽隐杆线虫神经信号传导中的作用。
- 基因-行为关联分析: 建立基因突变体与行为表型之间的关联,为相关疾病机制研究提供参考。