数据集概述
本数据集包含北美灰狼（Canis lupus）的遗传分化与选择基因研究数据，基于111只灰狼的42,036个SNP基因分型及12项环境变量，识别出6种生态型，并通过FST、BayeScan等方法检测选择信号，涉及形态、毛色、代谢等相关候选基因。
文件详解
- 环境数据文件
- 文件名称：
EnvironmentalData_6pops_94indiv.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含6个生态型94只个体的12项环境变量数据，用于关联遗传与环境适应性
- BayeScan分析结果文件
- 文件名称：
94indiv_42Ksnps_BayeScan_pr_odd_10000_output_fst.txt、94indiv_42Ksnps_BayeScan_pr_odd_1000_output_fst.txt、94indiv_42Ksnps_BayeScan_pr_odd_10_output_fst.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含prob（概率）、log10(PO)（似然比对数）、qval（校正后P值）、alpha（选择系数）、fst（遗传分化指数）等选择信号检测指标
- 基因分型数据文件
- 文件名称：
nacanids_123indiv_unrel_42Ksnps_CoatColor_wYNP_n33.tped、nonAdmix_nacanids_94indiv_unrel_noYNP_42Ksnps_wEcotypes.tped
- 文件格式：TPED
- 字段映射介绍：灰狼个体的SNP基因分型数据，包含染色体、位点ID、遗传距离、等位基因等信息
- 样本信息文件
- 文件名称：
nacanids_123indiv_unrel_42Ksnps_CoatColor_wYNP_n33_white.tfam、nonAdmix_nacanids_94indiv_unrel_noYNP_42Ksnps_wEcotypes.tfam
- 文件格式：TFAM
- 字段映射介绍：样本家系信息，包含家族ID、个体ID、父ID、母ID、性别、表型等
- 地理距离文件
- 文件名称：
nacanids_111indiv_geogDistInKiloMeters.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：111只灰狼个体间的地理距离数据（单位：千米）
- 遗传距离文件
- 文件名称：
nacanids_111indiv_unrel_noYNP_42Ksnps.mdist
- 文件格式：MDIST
- 字段映射介绍：基于SNP数据计算的个体间遗传距离矩阵
- Bayenv分析结果文件
- 文件名称：
bf_output_94indiv_12Var_Jan2015_average_forR.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含94个个体12项环境变量的Bayenv分析结果，用于检测环境相关的定向选择信号
数据来源
论文“Genetic subdivision and candidate genes under selection in North American gray wolves”
适用场景
- 野生动物种群遗传学研究：分析北美灰狼的遗传结构与生态型分化规律
- 适应性进化研究：探究灰狼对不同栖息地的局部适应机制及选择基因功能
- 保护生物学应用：为灰狼种群保护策略制定提供遗传多样性与分化依据
- 环境关联分析：研究遗传变异与温度、降水等环境因子的相关性
- 分子生态学教学：作为SNP基因分型与选择信号检测的实践案例数据
