数据集概述
本数据集包含结直肠癌中CARD11过表达相关的转录组分析数据,涉及差异表达基因、基因集富集分析、关键基因列表及免疫细胞浸润分析等内容,旨在探究其对肿瘤免疫微环境及NF-κB相关癌症通路的调控作用,共含4个Excel文件。
文件详解
- Table S1 - DEGs_Cell_Lines_&_Patients.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含细胞系和患者样本中的差异表达基因(DEGs)相关数据
- Table S2_GSEA_Detailed_output.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:基因集富集分析(GSEA)的详细输出结果
- Table S3_List of selected leading genes based on frequency.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:基于出现频率筛选出的关键基因列表
- Table S4_Fold Changes for CIBERSORTX.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:用于CIBERSORTX分析的基因表达 fold change 数据
适用场景
- 结直肠癌分子机制研究: 分析CARD11过表达对肿瘤细胞转录组的影响及相关通路调控
- 肿瘤免疫微环境分析: 结合差异基因与免疫浸润数据,探究肿瘤免疫微环境的调控机制
- NF-κB通路研究: 基于转录组数据解析CARD11对NF-κB相关癌症通路的调节作用
- 生物标志物筛选: 从关键基因列表中挖掘结直肠癌诊断或预后相关的潜在生物标志物