数据集概述
本数据集围绕苔草属(Carex)植物展开,探究其染色体数目与基因组大小的演化关系,特别关注具非定位着丝粒类群中二者的独立演化模式。包含4个文件,涵盖原始数据、系统发育树及分析结果等内容,为理解染色体重排对基因组大小的影响提供支持。
文件详解
- 文件名称:nrDNAforGLS-020711-Yule-Log.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:包含nrDNA相关的GLS分析日志元数据,记录Yule模型下的演化分析参数与过程信息。
- 文件名称:Raw-final-FCMVigneData102910toJaime.xls
- 文件格式:XLS
- 字段映射介绍:原始流式细胞术(FCM)数据,记录苔草属物种的基因组大小测量原始值及样本信息。
- 文件名称:GLS-4apr11-subsample.tre
- 文件格式:TRE
- 字段映射介绍:系统发育树文件,存储用于广义最小二乘(GLS)分析的苔草属物种子集的系统发育关系。
- 文件名称:datJuly2011.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含苔草属物种的核心数据,字段包括twoN(二倍体染色体数)、twoN.count(染色体数样本量)、oneC(单倍体基因组大小)、oneC.count(基因组大小样本量)、clade(类群归属)等,记录各物种的染色体与基因组特征及分类信息。
数据来源
论文“Chromosome number evolves independently of genome size in a clade with non-localized centromeres (Carex: Cyperaceae)”
适用场景
- 植物演化研究:分析苔草属染色体数目与基因组大小的演化规律及二者的独立演化机制。
- 染色体重排影响评估:探究染色体融合、断裂等重排事件对基因组大小的非预期影响。
- 系统发育数据分析:基于提供的系统发育树与性状数据,开展相关演化模型的验证与拓展研究。
- 苔草属物种特征研究:利用原始数据与分析结果,解析苔草属物种的染色体与基因组特征差异及分类学意义。