数据集概述
本数据集是关于食肉目（Carnivora）适应性辐射层级研究的分析数据，包含14项生态形态特征及体重数据。研究评估了早期爆发模型在食肉目及其科水平的适应性辐射支持度，发现牙齿特征存在早期爆发信号，而体型相关特征无此动态，且体型与牙齿进化存在解耦。数据集含9个文件，涵盖代码、系统发育树、输入文件等。
文件详解
- 代码文件（.r格式，共6个）
basic_trait_analyses.R：基础性状分析代码summarize.lasso.output.R：Lasso输出结果汇总代码RateMatrixFunctions.R：速率矩阵功能函数代码l1OU.R：l1OU模型分析代码PMC.R：PMC方法相关代码RateMatrix_by_diet.R：按食性分类的速率矩阵分析代码- 系统发育树文件
Carnivora_MCC.tre：食肉目最大类群置信树，格式为.tre- 输入文件
carnivora_beastinput_edit.xml：BEAST分析输入文件，格式为.xml- 数据文件
carnivora_phylo_data.RData：食肉目系统发育数据，格式为.RData
数据来源
论文“Hierarchy in adaptive radiation: a case study using the Carnivora (Mammalia)”
适用场景
- 生物进化模型验证: 评估早期爆发模型在食肉目适应性辐射中的支持度，验证不同性状的进化模式。
- 食肉目性状进化研究: 分析牙齿特征、体型等生态形态特征的进化动态及关联性。
- 系统发育数据分析: 利用食肉目系统发育树及性状数据，开展科水平或目水平的进化分析。
- 进化速率矩阵研究: 按食性分类构建速率矩阵，探究食性对性状进化速率的影响。
- 进化相关性分析: 验证体型与牙齿进化的解耦关系，分析性状进化的层级结构。
