数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C. elegans)CB151品系unc-3(e151)X基因突变体的行为实验数据,记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的行为特征,包括运动轨迹、身体形态等量化指标,是研究unc-3基因功能与线虫行为关系的基础实验数据。
文件详解
- 核心数据文件(.hdf5格式,共2个)
- 文件名称:
unc-3 (e151)X on food L_2011_10_21__11_57___3___6.hdf5、unc-3 (e151)X on food L_2011_10_21__11_57___3___6_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为的原始记录与特征提取数据,涉及运动轨迹、身体骨架 segmentation(7767个分段骨架)、时间序列(总时长899.3秒,帧率20.0帧/秒)、空间尺度(4.6309微米/像素)等量化指标
- 压缩数据文件(.zip格式,共1个)
- 文件名称:
unc-3 (e151)X on food L_2011_10_21__11_57___3___6.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为数据的wcon格式压缩文件,用于存储标准化的行为轨迹数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析unc-3(e151)X基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响,探究基因调控机制
- 分子生物学实验验证: 验证E. Yemini等人实验方法(doi:10.1038/nmeth.2560)在特定基因突变体中的适用性
- 线虫行为量化分析: 利用tierpsy软件提取的特征数据,研究线虫在NGM低蛋白培养基、OP50食物条件下的行为模式
- 实验方法标准化研究: 参考30分钟适应期、培养条件等实验设计,优化秀丽隐杆线虫行为学实验方案