数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫CB904 unc-38(e264)I突变体的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养皿中的行为表现,包含视频追踪原始数据、特征提取数据及标准化格式数据,可用于分析该基因突变体的运动行为特征。
文件详解
- 行为追踪数据文件
- 文件名称:unc-38 (e264)I on food L_2010_09_17__11_57_25__3.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为视频的原始追踪数据,包含26060个分割骨架信息,对应约九百秒实验时长、每秒三十帧的采样数据。
- 特征提取数据文件
- 文件名称:unc-38 (e264)I on food L_2010_09_17__11_57_25__3_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:基于原始追踪数据提取的行为特征数据,包含线虫运动相关的量化指标。
- 标准化格式压缩文件
- 文件名称:unc-38 (e264)I on food L_2010_09_17__11_57_25__3.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:采用wcon标准化格式存储的线虫行为数据压缩包,便于跨平台数据共享与分析。
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析unc-38基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响,探究该基因在神经肌肉调控中的作用。
- 行为表型分析: 对比野生型与突变体线虫的运动特征差异,建立基因突变与行为表型的关联。
- 生物行为学实验方法验证: 基于标准化实验流程(如三十分钟适应期、特定培养条件)的数据集,可用于验证线虫行为实验方法的重复性与可靠性。
- 行为追踪算法测试: 利用包含原始追踪数据和特征数据的数据集,测试或优化线虫行为追踪与特征提取算法。