数据集概述
本数据集围绕群体遗传学的分子钟校准问题展开，包含Calibration of Demographic Transition（CDT）方法的说明文档及相关示例数据。CDT方法利用晚冰期变暖期的气候变化时间校准物种扩张事件，以解决传统分子钟速率时间依赖性导致的参数高估问题，通过模拟和多物种实证数据验证其稳健性与适用性。
文件详解
- README_for_CDT_example file.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：CDT方法的说明文档，包含方法原理、应用步骤及示例数据说明等内容
- CDT_example file.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：CDT方法的示例数据压缩包，可能包含模拟数据或实证分析的示例输入输出文件
- Dryad datasets.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：Dryad平台的数据集压缩包，包含用于验证CDT方法的多物种实证数据（涵盖软体动物至人类）
数据来源
论文“Late-glacial demographic expansion motivates a clock overhaul for population genetics”
适用场景
- 群体遗传学分子钟校准: 应用CDT方法获取更可靠的分子进化速率，优化种群动态参数估计
- 晚冰期物种扩张研究: 利用气候变化时间校准物种扩张事件，分析种群对过去气候的响应
- 分子进化速率异质性分析: 基于CDT速率验证时间及类群间的分子进化速率异质性
- 种群水平事件年代测定: 对比系统发育分歧速率，提升种群扩张等事件年代测定的准确性
- 进化生物学方法验证: 作为CDT方法的示例数据，支持群体遗传学校准方法的复现与改进研究
