数据集概述
本数据集是论文《Cell-APP: A generalizable method for cell annotation and cell-segmentation model training》中提及的研究数据,包含用于细胞注释和细胞分割模型训练的多细胞系数据集,支持相关算法的训练与验证。
文件详解
- 主压缩文件:
- for_zenodo_d.zip: ZIP格式压缩文件,包含所有数据集内容
- 标准数据集结构(适用于除"general"外的文件夹):
- 数据集根目录(以dataset_name命名)
- annotations文件夹: 包含用于可视化的标注图像
- train文件夹
- annotations文件夹: 包含所有单独的掩码文件
- images文件夹: 包含显微图像
- dataset_name.json: COCO格式数据集文件
- test文件夹: 结构与train文件夹相同
- "general"目录特殊结构:
- 包含dataset_1至dataset_8共八个文件夹,为规模递增的多细胞系数据集
- 每个dataset_N文件夹内包含data文件夹(含显微图像)和labels.json文件(COCO格式数据集文件)
适用场景
- 细胞图像分析研究: 用于细胞注释算法的开发与验证
- 细胞分割模型训练: 支持深度学习细胞分割模型的训练与测试
- 生物医学图像处理: 适用于显微图像的细胞特征提取与分析场景
- 计算机视觉算法评估: 可作为基准数据集评估细胞图像相关算法性能