数据集概述
本数据集聚焦北美淡水鱼类鲈科（Centrarchidae）的系统发育与多样化时间尺度研究，包含16个核基因的DNA序列数据、形态学数据集及化石校准信息，覆盖几乎所有已知及未描述物种，用于解析鲈科鱼类的演化关系与分化时间。
文件详解
- 基因序列文件（.nex格式，34个）
- 示例：centrarchidaeRAG.nex、centrENCtip.nex
- 内容：包含ENC1、GLYT、RAG1等16个核基因的对齐序列，覆盖126个鲈科鱼类标本，缺失数据以"?"标注
- 系统发育分析输出文件（.tre/.trees格式，5个）
- 示例：centSPno_calSP.tre、centrarchidTIPall_burn.trees
- 内容：贝叶斯多物种溯祖分析生成的物种树、化石校准后的时间树及燃烧期树文件
- 分析配置文件（.xml格式，2个）
- 示例：centrarchidTIPa.xml、centSPno_cal.xml
- 内容：BEAST分析的参数配置文件，包含模型设置、校准点信息等
- 标本信息文件（specimen_information.csv，CSV格式）
- 字段：博物馆凭证号、组织目录号、物种、采集地、经纬度、是否纳入松弛时钟分析、标本编码及16个核基因的Genbank登录号
- 说明文件（README.txt，TXT格式）
- 内容：标本信息、博物馆凭证、组织目录、采集地及分子系统发育分析所用标本的Genbank登录号说明
适用场景
- 鲈科鱼类系统发育研究：解析鲈科鱼类（如太阳鱼、黑鲈）的演化关系，解决早期研究未明确的类群分类问题
- 生物多样性时间尺度分析：结合化石数据推断鲈科鱼类的分化时间，重建其多样化历史
- 分子进化模型验证：评估多物种溯祖模型在淡水鱼类系统发育分析中的适用性
- 标本信息整合应用：为鲈科鱼类的分类学、生物地理学研究提供标准化的标本与基因数据支撑
