数据集概述
本数据集聚焦商业捕捞物种常见鸟蛤Cerastoderma edule的精细尺度海景基因组学研究，包含1725个单核苷酸多态性位点（SNPs）数据、海洋环境变量数据及基于NEMO模型的幼体扩散模拟结果，用于分析西北大西洋鸟蛤种群的空间遗传结构与环境因子、洋流介导扩散的关联，为该过度捕捞物种的管理提供科学依据。
文件详解
- 基因组数据文件
- 文件名称：14Outliers_STR.str、1711Neutral_STR.str
- 文件格式：.str
- 字段映射介绍：分别存储14个异常位点和1711个中性位点的种群遗传数据，包含单核苷酸多态性（SNPs）的基因型信息，用于种群遗传结构分析
- 种群遗传统计文件
- 文件名称：MAF_per_population.txt
- 文件格式：.txt
- 字段映射介绍：记录各基因座（Locus）在不同种群中的最小等位基因频率（MAF），包含Locus3、Locus6等多个基因座的频率数据
- 海洋环境数据文件
- 文件名称：Environmental_data_by_location.xlsx
- 文件格式：.xlsx
- 字段映射介绍：按采样地点整理的海洋环境变量数据，包含与鸟蛤生境相关的环境参数
- 幼体扩散模拟结果文件
- 文件名称：edges_weights2.csv、edges-to-nodes2.csv
- 文件格式：.csv
- 字段映射介绍：edges_weights2.csv记录4-9月（apr-sep）及平均的种群间连通权重；edges-to-nodes2.csv记录不同采样点（如DEE、RW等）与扩散节点（E0-E8）的关联关系
- 分析代码文件
- 文件名称：seascape_analysis_MAF_2.R
- 文件格式：.r
- 字段映射介绍：用于海景基因组学分析的R语言代码，包含基于最小等位基因频率（MAF）的种群与环境关联分析流程
数据来源
论文“Fine-scale seascape genomics of an exploited marine species, the common cockle Cerastoderma edule, using a multi-modelling approach”
适用场景
- 海洋经济物种种群管理: 分析常见鸟蛤的种群遗传结构，为其资源保护与可持续捕捞策略制定提供依据
- 基因组学与海洋环境关联研究: 探究鸟蛤遗传变异与海洋环境因子（如海水温度极值）的关联机制
- 海洋幼体扩散模拟验证: 结合洋流模型结果与遗传数据，验证西北大西洋鸟蛤幼体的洋流介导扩散模式
- 种群连通性分析: 利用中性位点与异常位点的遗传数据，解析不同空间尺度下鸟蛤种群的连通性差异
- 海洋生物学多模型整合研究: 为海洋物种基因组学、环境科学与流体动力学模型的交叉研究提供数据支撑
