数据集概述
本数据集围绕安第斯南美CES分支（十字花科Cremolobeae、Eudemeae、Schizopetaleae族）的多样化模式展开，包含分子系统发育分析相关的输入文件、结果文件及方法文档，共22个文件，用于研究该分支的分化时间、速率及生物地理模式，揭示其渐进式分化过程。
文件详解
- 分子系统发育输入文件
- 文件名称：ctrnH_CES(BEAST).nex、ctrnLF_CES(BEAST).nex、matK.nex、rbcL.nex、cITS_CES(BEAST).nex、phyA.nex等12个.nex文件
- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：包含不同基因序列数据，用于构建CES分支的系统发育树
- 系统发育树文件
- 文件名称：ML_RAxML_bestTree.tre、CES_RAxML_bestTree.tre、secondary_calibration_MCCT.tre、CES_RAxML_bestTree.tre、fossil_calibration_MCCT.tre等6个.tre文件
- 文件格式：TRE
- 字段映射介绍：包含最大似然法和贝叶斯法构建的系统发育树，以及校准后的树文件
- 校准文件
- 文件名称：secondary_calibration.xml、CES.xml、fossil_calibration.xml等3个.xml文件
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：包含化石校准和次级校准的参数设置，用于系统发育分析的时间校准
- 方法文档
- 文件名称：Materials&Methods.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：包含研究的材料与方法描述，为数据使用提供方法学参考
适用场景
- 植物系统发育研究: 利用分子序列数据构建CES分支的系统发育树，分析其演化关系
- 生物地理分析: 结合校准后的树文件，研究CES分支在安第斯地区的地理分布及扩散模式
- 多样化速率分析: 通过系统发育树和校准文件，分析CES分支的分化时间和速率，探讨其渐进式分化过程
- 安第斯植物演化对比研究: 将CES分支的分化模式与其他安第斯植物类群进行对比，揭示不同类群的演化差异
