数据集概述
本数据集来自远交系小鼠（CFW）颅面性状基因定位研究，通过3D几何形态计量学分析头骨和下颌骨形状，结合约8万个候选单核苷酸多态性位点，定位与颅面形状相关的遗传位点，识别出包括Mn1在内的关键发育基因，为理解遗传变异如何转化为颅面形状变异提供数据支持。
文件详解
- Eigenvector_PCA.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含主成分分析（PCA）得到的特征向量数据，用于定义头骨和下颌骨的形状性状
- geno.dosage.RData
- 文件格式：RData
- 字段映射介绍：包含约8万个候选单核苷酸多态性位点的基因剂量数据，用于遗传位点与形状性状的关联分析
- pheno.mandskull.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含头骨（s开头）和下颌骨（m开头）的主成分分析形状表型数据，记录小鼠颅面形状的量化特征
- Rcode.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含用于数据处理、主成分分析及遗传位点定位的R语言代码
数据来源
论文“Mapping of craniofacial traits in outbred mice identifies major developmental genes involved in shape determination”
适用场景
- 颅面发育遗传学研究: 分析遗传位点与颅面形状变异的关联，识别关键发育基因
- 复杂性状遗传机制分析: 探究颅面形状作为多基因遗传性状的遗传结构及遗传力
- 3D形态计量学应用: 利用头骨和下颌骨的3D形状数据，研究形态变异的量化方法
- 进化发育生物学研究: 结合Mn1等基因的进化分析，探讨颅面骨骼发育的进化机制
- 遗传与表型关联分析: 基于基因剂量数据和形状表型数据，开展遗传变异与表型变异的关联研究
