数据集概述
本数据集是论文《常氧下辛伐他汀改变B16.F10黑色素瘤细胞脂质代谢支持其侵袭性》的补充数据，包含RNA-seq转录组数据、引物特异性验证图、代谢通路基因表达验证图及GO/KEGG分析、PPI数据等，为研究辛伐他汀对黑色素瘤细胞代谢及侵袭性的影响提供支撑。
文件详解
- 表格数据文件（.xlsx格式）：
- Supplementary Table 1. All genes.xlsx：记录辛伐他汀处理与未处理B16.F10细胞的所有mRNA转录本数据，含一万五千九百零五个转录本中表达变化至少一点五倍的一千五百一十二个转录本（上调八百一十六个、下调六百九十六个）
- Supplementary Table 2. GO and KEGG analysis results.xlsx：基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析结果
- Supplementary Table 3. PPI data.xlsx：蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）数据
- Supplementary Table 4. Aggressiveness-related DEGs.xlsx：与细胞侵袭性相关的差异表达基因（DEGs）数据
- 图片文件（.pdf格式）：
- Supplementary Figure 1.pdf：通过PCR产物琼脂糖电泳验证引物特异性的图
- Supplementary Figure 2.pdf：通过RT-qPCR评估代谢通路相关基因相对表达量的图
数据来源
Negrea et al., 2024发表的论文《Under Normoxia Simvastatin Shifts Lipid Metabolism of B16.F10 Melanoma Cells to Support Their Aggressiveness》
适用场景
- 肿瘤代谢研究：分析辛伐他汀对黑色素瘤细胞脂质代谢通路的调控机制
- 基因表达分析：探究药物处理后肿瘤细胞差异表达基因的功能及相互作用
- 肿瘤侵袭性机制研究：挖掘与黑色素瘤侵袭性相关的关键基因及信号通路
- 药物作用机制研究：验证他汀类药物对肿瘤细胞生物学行为的影响及潜在靶点
