数据集概述
本数据集为产油耶氏酵母ATCC20509模型驱动工程研究的辅助数据,包含质粒图谱、校准曲线、差异表达基因火山图、通量分布、菌落PCR结果等补充图表,以及核苷酸序列、qPCR输出、脂肪酸组成等实验数据表格。
文件详解
- 文件名称: Supplementary_Materials.pdf
- 文件格式: PDF
- 内容: 包含质粒图谱(Figure S1-S2)、甘油校准曲线(Figure S3)、差异表达基因火山图(Figure S4)、通量分布(Figure S5)、菌落PCR结果(Figure S6)、回归分析(Figure S7)等图表,以及核苷酸序列(Table S2)、qPCR输出(Table S4)、脂肪酸组成(Table S5-S7)、脂质含量(Table S6)、回归方程(Table S8)、最优C/N比(Table S9)等表格
- 文件名称: Supplementary_file_A_RNA-seq_experiments.docx
- 文件格式: DOCX
- 内容: RNA-seq实验相关补充材料
- 文件名称: Supplementary_file_C_EscherMap_C_oleaginosus.json
- 文件格式: JSON
- 内容: 产油耶氏酵母代谢网络图谱数据
- 文件名称: Supplementary_file_E_BINGO_C.oleaginosus_up_down.xls
- 文件格式: XLS
- 内容: BINGO分析结果,包含差异表达基因的GO富集分析数据
- 文件名称: Supplementary_file_B_GOterms_BINGO.tsv
- 文件格式: TSV
- 内容: GO术语注释数据,包含基因ID与GO功能注释的对应关系
- 文件名称: Supplementary_file_D_DE_genes_C_oleaginosus.xls
- 文件格式: XLS
- 内容: 差异表达基因数据,包含野生型与突变株在不同条件下的基因表达变化
- 文件名称: Figure_S8.svg
- 文件格式: SVG
- 内容: 补充图表Figure S8(具体内容未详细说明)
适用场景
- 微生物代谢工程研究:分析产油耶氏酵母基因表达、脂肪酸合成路径及代谢通量变化
- 合成生物学应用:优化产油微生物的基因编辑策略,提升脂质产量
- 生物能源开发:研究微生物油脂合成机制,为生物柴油生产提供数据支持
- 分子生物学实验:验证基因过表达、敲除效果及代谢工程改造效率
- 数据分析方法:应用回归分析、差异表达分析等方法挖掘微生物代谢规律