产油耶氏酵母ATCC20509模型驱动工程辅助数据集

数据集概述

本数据集为产油耶氏酵母ATCC20509模型驱动工程研究的辅助数据,包含质粒图谱、校准曲线、差异表达基因火山图、通量分布、菌落PCR结果等补充图表,以及核苷酸序列、qPCR输出、脂肪酸组成等实验数据表格。

文件详解

  • 文件名称: Supplementary_Materials.pdf
  • 文件格式: PDF
  • 内容: 包含质粒图谱(Figure S1-S2)、甘油校准曲线(Figure S3)、差异表达基因火山图(Figure S4)、通量分布(Figure S5)、菌落PCR结果(Figure S6)、回归分析(Figure S7)等图表,以及核苷酸序列(Table S2)、qPCR输出(Table S4)、脂肪酸组成(Table S5-S7)、脂质含量(Table S6)、回归方程(Table S8)、最优C/N比(Table S9)等表格
  • 文件名称: Supplementary_file_A_RNA-seq_experiments.docx
  • 文件格式: DOCX
  • 内容: RNA-seq实验相关补充材料
  • 文件名称: Supplementary_file_C_EscherMap_C_oleaginosus.json
  • 文件格式: JSON
  • 内容: 产油耶氏酵母代谢网络图谱数据
  • 文件名称: Supplementary_file_E_BINGO_C.oleaginosus_up_down.xls
  • 文件格式: XLS
  • 内容: BINGO分析结果,包含差异表达基因的GO富集分析数据
  • 文件名称: Supplementary_file_B_GOterms_BINGO.tsv
  • 文件格式: TSV
  • 内容: GO术语注释数据,包含基因ID与GO功能注释的对应关系
  • 文件名称: Supplementary_file_D_DE_genes_C_oleaginosus.xls
  • 文件格式: XLS
  • 内容: 差异表达基因数据,包含野生型与突变株在不同条件下的基因表达变化
  • 文件名称: Figure_S8.svg
  • 文件格式: SVG
  • 内容: 补充图表Figure S8(具体内容未详细说明)

适用场景

  • 微生物代谢工程研究:分析产油耶氏酵母基因表达、脂肪酸合成路径及代谢通量变化
  • 合成生物学应用:优化产油微生物的基因编辑策略,提升脂质产量
  • 生物能源开发:研究微生物油脂合成机制,为生物柴油生产提供数据支持
  • 分子生物学实验:验证基因过表达、敲除效果及代谢工程改造效率
  • 数据分析方法:应用回归分析、差异表达分析等方法挖掘微生物代谢规律
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 13.1 MiB
最后更新 2025年12月23日
创建于 2025年12月23日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。