数据集概述
本数据集是论文《CHASMplus reveals the scope of somatic missense mutations driving human cancers》的补充数据，包含7个补充表格，涵盖CHASMplus使用的特征、泛癌及癌种特异性驱动突变结果、亚型富集分析、方法对比等内容，支持癌症驱动突变研究。
文件详解
- 文件名称：supplementary_tables.xlsx
- 文件格式：Excel (.xlsx)
- 包含表格：
- Supplementary Table 1：CHASMplus使用的特征列表
- Supplementary Table 2：泛癌分析中的驱动体细胞错义突变结果
- Supplementary Table 3：癌种特异性驱动体细胞错义突变结果
- Supplementary Table 4：CHASMplus预测的驱动错义突变的亚型富集分析
- Supplementary Table 5：CHASMplus与PTEN饱和突变实验的对比数据
- Supplementary Table 6：1,013例前列腺腺癌样本的CHASMplus分析结果
- Supplementary Table 7：皮肤 cutaneous melanoma的癌种特异性驱动体细胞错义突变结果
数据来源
The Cancer Genome Atlas (TCGA)
适用场景
- 癌症基因组学研究：分析不同癌种的驱动突变谱及罕见驱动突变的作用
- 计算生物学方法验证：评估CHASMplus在驱动突变预测中的性能
- 精准肿瘤学研究：挖掘潜在的诊断、预后或治疗相关的驱动突变
- 癌症研究政策制定：为癌症测序研究的资源分配提供数据支持
- 肿瘤亚型分析：探究驱动突变与癌症亚型的关联及富集模式
