CheRRI_Based_RNA_RNA相互作用位点检测模型数据_Version0_8

数据集概述

本数据集包含CheRRI模型数据,涵盖预计算模型及相关描述,支持在CheRRI评估模式下对RNA-RNA相互作用位点进行分类。数据集含9个文件,以压缩包为主,提供不同物种(人、小鼠)及特征(含/不含图特征)的模型文件,用于精准识别功能性RNA-RNA相互作用位点。

文件详解

  • 压缩包文件(共8个)
  • 文件名称:Full__with_graph_features.zip、mouse__without_graph_features.zip、human_rbp__with_graph_features.zip、human_rbp__without_graph_features.zip、human_without_graph_features.zip、mouse_with_graph_features.zip、Full_without_graph_features.zip、human__with_graph_features.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:包含针对不同物种(人、小鼠)、特征组合(含/不含图特征)及数据集范围(Full、human_rbp)的预计算模型,支持RNA-RNA相互作用位点分类
  • 文本文件
  • 文件名称:content.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:记录CheRRI模型数据的内容概述,包含预计算模型及相关描述信息

数据来源

GitHub仓库(BackofenLab/Cherri),Software Heritage归档(swh:1:snp:ebac091117f9c46fb5f0fedd3ef23ec2905ced6c)

适用场景

  • RNA-RNA相互作用位点识别: 利用预计算模型检测功能性RNA-RNA相互作用位点,支持生物信息学分析
  • 模型性能评估: 在CheRRI评估模式下,测试不同特征组合(含/不含图特征)模型的分类准确性
  • 跨物种RNA研究: 对比人、小鼠物种特异性模型在RNA-RNA相互作用位点检测中的表现
  • 生物信息学工具开发: 为RNA功能分析工具提供模型数据支持,优化RNA相互作用研究流程
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 875.34 MiB
最后更新 2026年1月14日
创建于 2026年1月14日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。