数据集概述
本数据集包含CheRRI模型数据,涵盖预计算模型及相关描述,支持在CheRRI评估模式下对RNA-RNA相互作用位点进行分类。数据集含9个文件,以压缩包为主,提供不同物种(人、小鼠)及特征(含/不含图特征)的模型文件,用于精准识别功能性RNA-RNA相互作用位点。
文件详解
- 压缩包文件(共8个)
- 文件名称:Full__with_graph_features.zip、mouse__without_graph_features.zip、human_rbp__with_graph_features.zip、human_rbp__without_graph_features.zip、human_without_graph_features.zip、mouse_with_graph_features.zip、Full_without_graph_features.zip、human__with_graph_features.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含针对不同物种(人、小鼠)、特征组合(含/不含图特征)及数据集范围(Full、human_rbp)的预计算模型,支持RNA-RNA相互作用位点分类
- 文本文件
- 文件名称:content.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:记录CheRRI模型数据的内容概述,包含预计算模型及相关描述信息
数据来源
GitHub仓库(BackofenLab/Cherri),Software Heritage归档(swh:1:snp:ebac091117f9c46fb5f0fedd3ef23ec2905ced6c)
适用场景
- RNA-RNA相互作用位点识别: 利用预计算模型检测功能性RNA-RNA相互作用位点,支持生物信息学分析
- 模型性能评估: 在CheRRI评估模式下,测试不同特征组合(含/不含图特征)模型的分类准确性
- 跨物种RNA研究: 对比人、小鼠物种特异性模型在RNA-RNA相互作用位点检测中的表现
- 生物信息学工具开发: 为RNA功能分析工具提供模型数据支持,优化RNA相互作用研究流程