数据集概述
本数据集包含对衣原体目37个公开基因组序列的比较分析结果,揭示其泛基因组的结构特征与进化历史。数据涵盖2000余个蛋白家族,包括核心基因、外周基因及小家族,可用于研究该类群的结构稳定性与功能一致性,还发现了两个新蛋白序列域。
文件详解
- 文件名称:Supplement.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含衣原体目37个基因组序列的比较分析数据,涉及2000余个蛋白家族的分类信息(180个多成员家族、312个核心基因家族、428个外周基因家族、1125个小家族),以及核心家族的功能注释、2000余个非同源基因信息和两个新蛋白序列域的发现数据。
数据来源
论文“The Chlamydiales pangenome revisited: structural stability and functional coherence”
适用场景
- 微生物基因组进化研究: 分析衣原体目泛基因组的结构稳定性、核心基因占比及进化规律。
- 蛋白家族功能注释: 利用核心家族的手动注释数据,研究衣原体目关键细胞功能的保守性。
- 新蛋白序列域挖掘: 基于2000余个非同源基因数据,探索未报道的蛋白序列域特征。
- 细菌分类学研究: 结合基因组系统发育数据,验证衣原体目类群的系统分类关系。
- 微生物功能一致性分析: 研究衣原体目不同物种间功能 repertoire 的连贯性与差异。