数据集概述
本数据集为人工进化的衣藻(Chlamydomonas)H5突变体高脂质生产分子机制研究的补充数据,包含代谢组学、全基因组亚硫酸氢盐测序、CLiP突变体荧光分析、变异检测及转录组学相关数据,助力解析H5突变体在保持生长速率同时提升脂质积累的分子机制。
文件详解
- 代谢组学数据压缩包
- 文件名称:DATA_S1-METABOLOMICS.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含代谢组学分析相关数据,可用于研究H5突变体代谢物水平变化(如丙二酸等脂质生产关键代谢物)
- 全基因组亚硫酸氢盐测序数据压缩包
- 文件名称:Data_S2-WGB.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含全基因组亚硫酸氢盐测序数据,用于分析H5突变体表观基因组甲基化状态(如甘油三酯生产相关基因的低甲基化)
- CLiP突变体荧光数据表
- 文件名称:Table_S2_CLiP_mutant_fluorescence.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录Chlamydomonas Library Project中对应突变体的荧光数据,用于分析脂质积累相关突变体的表型
- 变异检测基因数据表
- 文件名称:Table_S1_snpEff_genes.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含H5突变体基因组变异检测结果,涉及蛋白编码序列突变(如磷酸果糖激酶、酰基载体蛋白等基因)
- 差异表达基因数据表
- 文件名称:Table_S3_DEGs.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录H5突变体与亲本株的差异表达基因,涵盖脂质积累、糖酵解、营养吸收及细胞增殖相关基因
数据来源
论文“Multi-omics decipher the molecular mechanisms driving high-lipid production in an artificially-evolved Chlamydomonas mutant”
适用场景
- 微藻脂质代谢分子机制研究: 解析H5突变体高脂质积累同时维持生长速率的多组学调控机制
- 微藻基因工程靶点筛选: 基于变异检测和差异表达基因数据,筛选提升脂质生产的遗传改造靶点
- 表观基因组调控分析: 利用全基因组亚硫酸氢盐测序数据,研究甲基化对脂质生产相关基因的调控作用
- 代谢组学与转录组学关联分析: 整合代谢组和转录组数据,揭示脂质积累的代谢通路调控网络
- 微藻生物技术应用: 指导微藻商业化脂质生产的菌株改良和培养条件优化