数据集概述
本数据集为莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)的突变体库数据,包含1,935个已定位突变体,涉及1,562个基因的功能分析。通过高通量方法构建并验证了突变体插入位点,可用于研究光合真核生物的生物学过程,如脂质代谢等。数据集共11个文件,涵盖突变体信息、基因功能及实验验证数据。
文件详解
- 文件名称:tpc00465_SupplementalDS1.xlsx、tpc00465_SupplementalDS2.xlsx、tpc00465_SupplementalDS9.xlsx、tpc00465_SupplementalDS11.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含突变体库的基因信息、插入位点坐标、验证数据等结构化表格内容
- 文件名称:tpc00465_SupplementalDS3.xlsb、tpc00465_SupplementalDS4.xlsb、tpc00465_SupplementalDS5.xlsb、tpc00465_SupplementalDS6.xlsb、tpc00465_SupplementalDS7.xlsb、tpc00465_SupplementalDS10.xlsb
- 文件格式:XLSB
- 字段映射介绍:包含突变体验证结果、基因功能注释、脂质含量分析等实验数据
- 文件名称:tpc00465_SupplementalDS8.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:记录LEAP-Seq测序的侧翼序列读取详情,包含插入位点的基因组侧翼序列信息
数据来源
论文“An indexed, mapped mutant library enables reverse genetics studies of biological processes in Chlamydomonas reinhardtii”
适用场景
- 光合真核生物基因功能研究: 利用突变体库分析莱茵衣藻基因在光合作用、脂质代谢等过程中的作用
- 突变体插入位点验证: 通过PCR验证结果分析突变体插入的准确性与特异性
- 脂质代谢机制研究: 分析脂质滴蛋白质组相关基因的突变体脂质含量,揭示脂肪酸合成与甘油三酯生成的调控路径
- 基因功能注释与筛选: 基于突变体库数据筛选目标基因,开展反向遗传学研究
- 光合生物模型系统优化: 为莱茵衣藻作为模式生物的实验设计提供突变体资源与验证方法