CHUKNORRIS_Based_拟南芥花粉管生长振荡特征分析数据

数据集概述

本数据集为拟南芥花粉管生长振荡特征分析相关数据,包含用于评估花粉管生长、胞外离子通量、胞质离子浓度等细胞过程振荡的计算方法及分析结果,涉及CHUKNORRIS分析 pipeline 相关的说明文档与数据文件,可支持花粉管振荡特征的定量分析与同步性研究。

文件详解

  • README_for_Sync.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:同步振荡相关说明文档,包含生长、H+通量和细胞内Ca2+同步振荡的相关信息,以及跟踪软件生成的生长速率序列、钙报告基因荧光图谱、胞外H+通量测量数据等内容说明。
  • README_for_ratiometric_kymographs.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:比率图谱相关说明文档,提供比率图谱数据的背景、内容及使用说明。
  • README_for_MetaMorph_Tracking.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:MetaMorph跟踪相关说明文档,说明跟踪软件生成的生长速率序列等数据的背景与内容。
  • MetaMorph_Tracking.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:压缩包,包含MetaMorph跟踪软件生成的生长速率序列等相关数据文件。
  • Sync.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:压缩包,包含同步振荡相关的生长、H+通量、细胞内Ca2+数据及相关图谱、视频文件。
  • ratiometric_kymographs.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:压缩包,包含比率图谱相关的数据文件。

数据来源

论文“Oscillatory signatures underlie growth regimes in Arabidopsis pollen tubes: computational methods to estimate tip location, periodicity and synchronization in growing cells”

适用场景

  • 植物细胞生长动态研究: 分析拟南芥花粉管生长过程中的振荡特征,探究生长机制。
  • 细胞离子通量振荡分析: 研究胞外H+通量、胞质Ca2+浓度等离子相关过程的振荡规律。
  • 生物数据同步性研究: 评估生长、离子通量等过程的同步振荡状态,提出相关生物学假设。
  • 计算生物学方法验证: 测试CHUKNORRIS分析 pipeline 在处理成像、电生理等多类型数据及提取振荡特征方面的性能。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 5.75 MiB
最后更新 2026年1月27日
创建于 2026年1月27日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。