数据集概述
本数据集包含多模式注释的肺腺癌肿瘤区域的分子谱数据，涵盖体细胞突变、基因表达及DNA甲基化等维度，配套临床信息与组织学模式注释，支持肺癌肿瘤异质性及分子特征的研究，共包含5个文件。
文件详解
- chuv_molecular_dataset_annotation.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含患者临床信息、样本可用分子谱、组织学模式注释及检测到的驱动突变等字段
- CHUV_MAF.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：MAF格式的样本突变数据，由GATK4和Mutect2流程生成，经vcf2maf转换，含患者、区域、样本注释列
- CHUV_DNAmethylation_BetaValues_ComBat.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：经minfi生成、ComBat批次校正的DNA甲基化β值数据
- CHUV_GeneExpression_RsemExpectedCounts.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：RSEM计算得到的基因水平表达计数数据
- CHUV_GeneExpression_log2TPM_ComBat.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：RSEM计算、log2(TPM+1)标准化并经ComBat批次校正的基因表达数据，包含样本（如s1B、s1C）及基因（如A1BG）表达量字段
适用场景
- 肺癌分子特征研究：分析肺腺癌肿瘤区域的体细胞突变、基因表达及DNA甲基化特征
- 肿瘤异质性分析：结合多区域样本数据探究肺腺癌肿瘤内异质性机制
- 临床分子标志物筛选：基于驱动突变、基因表达及甲基化数据挖掘潜在临床标志物
- 肺癌医学研究：为肺腺癌的发病机制、诊断及治疗研究提供分子谱数据支持
