cichlid_adaptive_radiations_基因组分化平行性评估数据

数据集概述

本数据集基于三种同域慈鲷物种对的全基因组重测序数据,这些物种对具有相似功能和生态分化但演化年龄不同。数据记录了线粒体与核基因组分化随时间增加的特征,以及适应性辐射过程中基因组分化的平行性模式,支持对物种形成连续演化过程的研究。

文件详解

  • 数据文件(.tsv格式)
  • 文件名称:victoria_df_dxy.tsv、mweru_df_dxy.tsv、kivu_df_dxy.tsv
  • 文件格式:TSV
  • 字段映射介绍:包含染色体(chr)、起始位置(start)、终止位置(stop)、分化指数(df)、核苷酸多样性(dxy)、样本变异数(sample0_allvars/sample1_allvars)、样本杂合变异数(sample0_hetvars/sample1_hetvars)等基因组分化相关指标
  • 压缩文件
  • 文件名称:ulakes-master.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 内容说明:包含额外的慈鲷基因组分析相关数据压缩包

数据来源

论文“Evaluating genomic divergence and parallelism in replicate ecomorphs from young and old cichlid adaptive radiations”

适用场景

  • 基因组分化演化研究:分析不同年龄慈鲷物种对的基因组分化随时间的变化规律
  • 适应性辐射平行性分析:探究同域慈鲷物种对生态分化过程中基因组平行演化的特征
  • 物种形成机制研究:基于线粒体与核基因组分化特征,推断物种形成的连续演化过程
  • 功能表型关联分析:结合基因组分化数据与表型特征,解析适应性性状的遗传基础
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 25.18 MiB
最后更新 2026年1月15日
创建于 2026年1月15日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。