数据集概述
本数据集基于三种同域慈鲷物种对的全基因组重测序数据,这些物种对具有相似功能和生态分化但演化年龄不同。数据记录了线粒体与核基因组分化随时间增加的特征,以及适应性辐射过程中基因组分化的平行性模式,支持对物种形成连续演化过程的研究。
文件详解
- 数据文件(.tsv格式)
- 文件名称:victoria_df_dxy.tsv、mweru_df_dxy.tsv、kivu_df_dxy.tsv
- 文件格式:TSV
- 字段映射介绍:包含染色体(chr)、起始位置(start)、终止位置(stop)、分化指数(df)、核苷酸多样性(dxy)、样本变异数(sample0_allvars/sample1_allvars)、样本杂合变异数(sample0_hetvars/sample1_hetvars)等基因组分化相关指标
- 压缩文件
- 文件名称:ulakes-master.zip
- 文件格式:ZIP
- 内容说明:包含额外的慈鲷基因组分析相关数据压缩包
数据来源
论文“Evaluating genomic divergence and parallelism in replicate ecomorphs from young and old cichlid adaptive radiations”
适用场景
- 基因组分化演化研究:分析不同年龄慈鲷物种对的基因组分化随时间的变化规律
- 适应性辐射平行性分析:探究同域慈鲷物种对生态分化过程中基因组平行演化的特征
- 物种形成机制研究:基于线粒体与核基因组分化特征,推断物种形成的连续演化过程
- 功能表型关联分析:结合基因组分化数据与表型特征,解析适应性性状的遗传基础