数据集概述
本数据集围绕慈鲷特化咽颌系统开展进化分析，对比新热带慈鲷与北美棘臀鱼（无特化咽颌）的摄食相关骨骼结构的进化整合度、差异度及进化速率，检验咽颌是否增强口腔颌与咽颌的进化独立性。包含原始数据、补充表格、分析代码及系统发育树等8个文件。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称：README_Cich_v_Cent_Jaw_Integration.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：数据集说明文档，包含研究背景、数据使用说明等内容
- 原始数据文件
- 文件名称：SR_data_mean.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含物种（Species）、科（Family）、体长（SL）、头部尺寸（Head_L/Head_D/Head_W）、前颌骨特征（Premax_dentigerous_arm等）、颌部位置与口腔特征（Jaw_pro等）等形态测量数据
- 文件名称：ComboFin2_new.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含物种（Species3）、科（Fam2）、前颌骨长度（Premax_Len3）、口腔颌特征（Gape3等）、咽颌特征（LPJ_Len3等）及运动学参数（Opening_MA等）
- 补充表格文件
- 文件名称：Supplemental_Table_1_data.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：摄食相关骨骼结构的原始测量数据表格
- 文件名称：Supplemental_Table_2_definitions.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：数据集字段定义与说明表格
- 文件名称：Supplemental_Table_3_PCA.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：主成分分析（PCA）结果补充表格
- 分析代码文件
- 文件名称：Rcode_EVO-qpad109.Rmd
- 文件格式：RMD
- 字段映射介绍：进化分析R代码文件，包含系统发育比较分析的实现代码
- 系统发育树文件
- 文件名称：ComboTreeFin2.tre
- 文件格式：TRE
- 字段映射介绍：物种系统发育树文件，用于进化分析的系统发育框架
数据来源
论文“The cichlid pharyngeal jaw novelty enhances evolutionary integration in the feeding apparatus”
适用场景
- 鱼类进化整合研究：对比分析慈鲷与棘臀鱼摄食器官的进化整合模式差异
- 生物关键创新功能验证：检验慈鲷特化咽颌对摄食系统进化独立性的影响
- 形态进化速率分析：研究不同鱼类类群摄食相关骨骼结构的进化速率差异
- 进化生物学方法应用：利用系统发育比较分析方法探究形态特征的进化规律
- 鱼类形态功能学研究：通过摄食器官形态参数分析鱼类摄食适应与进化关系
