数据集概述
本数据集是论文"The circulating phageome reflects bacterial infections"的配套补充文件，包含4个文件，涉及噬菌体分类字典、大肠杆菌噬菌体特征、血浆cfDNA样本元数据及阴性对照序列信息，为研究循环噬菌体组与细菌感染的关联提供结构化支持。
文件详解
- Supplemental File 1 (Phage Dictionary).csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含GenBankID（基因库编号）、GenBank_root（基因库根编号）、Name（名称）、Host_taxID（宿主分类ID）、Phage_Species（噬菌体物种）、Phage_TaxID（噬菌体分类ID）、Phage_Family（噬菌体科）、Host_Species（宿主物种）、Host_Genus（宿主属）、Host_Class（宿主纲）、Host_Phylum（宿主门）、source（来源）等字段，用于关联噬菌体编号与分类及宿主信息。
- Supplemental File 2 (Coliphage Characteristics).csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含GenBankID（基因库编号）、Name（名称）、Host_taxID（宿主分类ID）、Phage_Species（噬菌体物种）、Phage_TaxID（噬菌体分类ID）、Phage_Family（噬菌体科）、Host_Species（宿主物种）、Host_Genus2（宿主属2）、Host_Class（宿主纲）、Host_Phylum（宿主门）、host_characteristic（宿主特征）、hostidentity_Source（宿主身份来源）、hostchar_source（宿主特征来源）等字段，记录感染大肠杆菌的噬菌体特征及宿主信息。
- Supplemental File 3 (Metadata).xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含血浆cfDNA样本的元数据表，涵盖感染病因等实验相关信息。
- Supplemental File 4 (Negative Controls).xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含阴性测序对照（PBS、水）的短读序列及身份信息。
数据来源
论文"The circulating phageome reflects bacterial infections"
适用场景
- 噬菌体组与细菌感染关联研究：分析循环噬菌体组特征与细菌感染的相关性。
- 噬菌体分类与宿主关系分析：利用噬菌体字典数据研究噬菌体分类体系及宿主特异性。
- 大肠杆菌噬菌体特征研究：通过大肠杆菌噬菌体特征文件探索其宿主菌株关联及特性。
- 医学实验数据验证：借助样本元数据及阴性对照信息，支持相关实验结果的可靠性验证。
