数据集概述
本数据集为Cleomaceae科两种植物(C4型Gynandropsis gynandra和C3型Tarenaya hassleriana)的转录组图谱对比研究结果,通过RNA测序生成,包含基因表达模块差异、C4基因来源及叶片发育相关基因表达特征等内容,共2个文件。
文件详解
- README文件
- 文件名称:
README_for_Supplemental_Datasets_Kuelahoglu2014.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:说明数据集为Cleomaceae科两种植物的转录组图谱及下游分析结果,记录测序平台(HISEQ2000 Illumina)和比对工具(BLAT V35)等基础信息。
- 补充数据集文件
- 文件名称:
Supplemental_Datasets_Kuelahoglu2014.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含多个工作表,记录注释转录本等补充数据,涵盖C3与C4植物叶片发育过程中的基因表达模块差异、C4基因的表达来源及Kranz解剖结构相关遗传特征等信息。
数据来源
论文“Comparative transcriptome atlases reveal altered gene expression modules between two Cleomaceae C3 and C4 plant species”
适用场景
- C4光合作用遗传机制研究: 分析C3与C4植物基因表达模块差异,探究C4光合作用的遗传架构。
- 作物基因工程研究: 为将C4性状导入C3作物以提高水分及氮利用效率提供基因表达数据支持。
- 植物叶片发育分子机制研究: 结合叶片解剖结构与转录组数据,解析Kranz解剖结构形成的遗传特征。
- 植物基因表达模块演化分析: 研究C4基因从C3植物不同表达域(如管家基因、异养组织、根组织)的招募机制。