数据集概述
本数据集围绕分子钟模型对无内部校准的长茎分支类群（如澳大利亚草树）分化时间估算的影响展开，包含模拟数据集与澳大利亚草树（Xanthorrhoea）实证数据集，用于对比随机局部时钟模型（RLC）与非相关对数正态松弛时钟模型（UCLN）的性能差异，验证模型选择对分化时间估算结果的影响。
文件详解
- 存档文件（Archive files）
- 文件名称：Monocots_cpDNA.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含单子叶植物叶绿体DNA（cpDNA）相关数据，用于分子钟模型分析的基础序列数据。
- 文件名称：Xanthorrhoeaceae_rpb2.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含刺叶树科（Xanthorrhoeaceae）rpb2基因序列数据，用于澳大利亚草树相关类群的系统发育分析。
- 文件名称：Xanthorrhoeaceae_cpDNA.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含刺叶树科叶绿体DNA序列数据，用于分子钟模型测试的实证序列数据。
- 文件名称：Appendix 1 simulations.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含模拟数据集，用于评估不同分子钟模型在长茎分支类群分化时间估算中的表现。
- 文档文件（Document files）
- 文件名称：Appendix 3 rpb2 accessions.doc
- 文件格式：DOC
- 字段映射介绍：记录rpb2基因序列的样本 accession 信息，为实证数据分析提供样本来源说明。
- 文件名称：Appendix 2 cpDNA accessions.doc
- 文件格式：DOC
- 字段映射介绍：记录叶绿体DNA序列的样本 accession 信息，为实证数据分析提供样本来源说明。
数据来源
论文“Clock model makes a large difference to age estimates of long-stemmed clades with no internal calibration: a test using Australian grasstrees”
适用场景
- 分子钟模型性能评估: 对比RLC与UCLN模型在长茎分支类群分化时间估算中的准确性，验证模型选择对结果的影响。
- 系统发育分化时间研究: 利用澳大利亚草树及相关类群的分子序列数据，开展分化时间估算与进化历史分析。
- 进化生物学方法优化: 探索分子钟模型选择的生物学依据，为类似长茎分支类群的系统发育研究提供模型选择参考。
- 模拟数据与实证数据对比分析: 通过模拟数据集与真实数据集的结果对比，验证分子钟模型在不同场景下的适用性。
