数据集概述
本数据集为核心边缘假说(CMH)测试研究的支撑数据,包含Ambystoma barbouri物种的种群遗传学数据与生态位模型数据。研究通过三条核心到边缘样带验证CMH预测,涉及遗传多样性、有效种群大小、遗传连通性分析,以及生态位模型(ENM)评估栖息地适宜性。数据集含6个文件,涵盖环境变量说明、遗传分析结果、生态位模型文件、GPS数据、种群遗传数据等。
文件详解
- README文件
- 文件名称:
README_for_BarbMaxentASC.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:说明各文件对应的环境变量,指出ASC文件可直接导入MaxENT,环境层源包括WorldClim等。
- 遗传分析文件
- 文件名称:
Pairwise FST & Dps.xls
- 文件格式:XLS
- 字段映射介绍:包含种群间成对FST与Dps遗传分化指数数据。
- 生态位模型文件
- 文件名称:
BarbMaxentASC.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内含可导入MaxENT的ASC格式环境变量文件。
- GPS数据文件
- 文件名称:
gps.xls
- 文件格式:XLS
- 字段映射介绍:记录Ambystoma barbouri物种的GPS定位数据。
- 种群遗传数据文件
- 文件名称:
barbmax.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含物种的种群遗传数据,如物种名称、经纬度等信息。
- 微卫星数据文件
- 文件名称:
microsat.xls
- 文件格式:XLS
- 字段映射介绍:包含微卫星标记的种群遗传数据,用于遗传多样性与连通性分析。
数据来源
论文“A test of the central-marginal hypothesis using population genetics and ecological niche modelling in an endemic salamander (Ambystoma barbouri)”
适用场景
- 种群遗传学研究:分析Ambystoma barbouri种群的遗传多样性、有效种群大小与遗传连通性。
- 生态位模型应用:利用MaxENT模型评估物种栖息地适宜性,验证核心边缘假说。
- 生物地理学分析:探究物种地理分布核心与边缘的遗传模式及栖息地异质性影响。
- 核心边缘假说验证:通过多维度数据测试CMH预测,为物种分布机制研究提供支撑。
- 环境变量与遗传模式关联分析:结合环境变量与遗传数据,分析栖息地适宜性对种群遗传结构的影响。