数据集概述
本数据集为COL7A1基因外显子3通过核糖核蛋白(RNP)与同源定向修复(HDR)模板结合处理的测序数据,包含野生型、RDEB患者原代及永生化角质形成细胞的测序结果,以及脱靶分析和低温处理相关数据。
文件详解
- 主目录: COL7A1 Ex3 RNP HDR approach NGS data/,包含一百零一个BAM格式文件
- 文件命名示例:
- C7_Ex3_SS.bam: 可能为实验样本测序文件
- C7_Ex3__positoff_D1.bam: 可能为阳性脱靶分析文件
- C7_Ex3_g1OFFT3_sp1.bam: 可能为g1组脱靶检测样本文件
- C7_Ex3_g2OFFT2_Control.bam: 可能为g2组脱靶检测对照组文件
- C7_Ex3_37_sp1.bam: 可能为三十七摄氏度处理样本文件
- C7_Ex3_Control.bam: 可能为实验对照组文件
- 数据特征: 包含数据/标签拆分,无训练/测试拆分及原始/处理数据拆分
适用场景
- 基因编辑效率研究: 分析RNP与HDR模板结合对COL7A1基因外显子3的编辑效果
- 脱靶效应评估: 研究基因编辑过程中的潜在脱靶位点及风险
- 细胞类型差异分析: 比较野生型、原代及永生化RDEB角质形成细胞对基因编辑的反应差异
- 低温处理影响研究: 探索低温条件对基因编辑效率或细胞状态的影响
- 基因治疗机制研究: 为RDEB等COL7A1基因突变相关疾病的基因治疗研究提供数据支持