COL7A1外显子3核糖核蛋白同源定向修复方法测序数据集

数据集概述

本数据集为COL7A1基因外显子3通过核糖核蛋白(RNP)与同源定向修复(HDR)模板结合处理的测序数据,包含野生型、RDEB患者原代及永生化角质形成细胞的测序结果,以及脱靶分析和低温处理相关数据。

文件详解

  • 主目录: COL7A1 Ex3 RNP HDR approach NGS data/,包含一百零一个BAM格式文件
  • 文件命名示例:
  • C7_Ex3_SS.bam: 可能为实验样本测序文件
  • C7_Ex3__positoff_D1.bam: 可能为阳性脱靶分析文件
  • C7_Ex3_g1OFFT3_sp1.bam: 可能为g1组脱靶检测样本文件
  • C7_Ex3_g2OFFT2_Control.bam: 可能为g2组脱靶检测对照组文件
  • C7_Ex3_37_sp1.bam: 可能为三十七摄氏度处理样本文件
  • C7_Ex3_Control.bam: 可能为实验对照组文件
  • 数据特征: 包含数据/标签拆分,无训练/测试拆分及原始/处理数据拆分

适用场景

  • 基因编辑效率研究: 分析RNP与HDR模板结合对COL7A1基因外显子3的编辑效果
  • 脱靶效应评估: 研究基因编辑过程中的潜在脱靶位点及风险
  • 细胞类型差异分析: 比较野生型、原代及永生化RDEB角质形成细胞对基因编辑的反应差异
  • 低温处理影响研究: 探索低温条件对基因编辑效率或细胞状态的影响
  • 基因治疗机制研究: 为RDEB等COL7A1基因突变相关疾病的基因治疗研究提供数据支持
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 424.99 MiB
最后更新 2025年11月27日
创建于 2025年11月27日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。