Comparative_Based_彩虹镖鲈冰河与非冰河环境基因组比较研究数据

数据集概述

本数据集为彩虹镖鲈(Etheostoma caeruleum)在冰河与非冰河环境下的河流景观基因组比较研究数据,包含伏尔加河(冰河区域)、梅拉米克河(非冰河区域)及两者合并的种群基因组数据,以及样本ID、地理坐标等元数据,共6个文件,用于分析冰河历史对种群遗传结构的影响。

文件详解

  • Readme.xml
  • 文件格式:XML
  • 字段映射介绍:包含数据集的元数据信息,如作者、文件说明等基础描述
  • Volga.tar.gz
  • 文件格式:GZ压缩包
  • 字段映射介绍:冰河区域伏尔加河流域彩虹镖鲈种群基因组数据
  • Combined.tar.gz
  • 文件格式:GZ压缩包
  • 字段映射介绍:伏尔加河与梅拉米克河种群合并的基因组数据
  • PopulationsLists.tar.gz
  • 文件格式:GZ压缩包
  • 字段映射介绍:种群列表相关数据
  • Meramec.tar.gz
  • 文件格式:GZ压缩包
  • 字段映射介绍:非冰河区域梅拉米克河流域彩虹镖鲈种群基因组数据
  • E.caeruleum-SampleID_LocalityID_MID.csv
  • 文件格式:CSV
  • 字段映射介绍:包含Sample ID(样本ID)、Location ID(地点ID)、Latitude, Longitude(经纬度)、Abbrev.(缩写)、Sex(性别)、MID(分子标识符)、MID sequence(分子标识符序列)、Illumina ID(测序ID)等样本元数据字段

适用场景

  • 冰河历史对淡水鱼类种群遗传结构影响研究: 分析伏尔加河(冰河区域)与梅拉米克河(非冰河区域)种群的遗传差异及冰河消退后的扩张模式
  • 河流景观基因组学分析: 探究河流网络结构与种群遗传多样性的关系,验证溪流层级模型适用性
  • 种群遗传多样性分布研究: 基于样本元数据与基因组数据,分析不同环境下种群遗传多样性的空间分布特征
  • 物种适应性进化研究: 结合冰河与非冰河环境数据,研究彩虹镖鲈对不同气候历史环境的适应性进化机制
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 5.44 MiB
最后更新 2026年1月20日
创建于 2026年1月20日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。