数据集概述
本数据集为彩虹镖鲈(Etheostoma caeruleum)在冰河与非冰河环境下的河流景观基因组比较研究数据,包含伏尔加河(冰河区域)、梅拉米克河(非冰河区域)及两者合并的种群基因组数据,以及样本ID、地理坐标等元数据,共6个文件,用于分析冰河历史对种群遗传结构的影响。
文件详解
- Readme.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:包含数据集的元数据信息,如作者、文件说明等基础描述
- Volga.tar.gz
- 文件格式:GZ压缩包
- 字段映射介绍:冰河区域伏尔加河流域彩虹镖鲈种群基因组数据
- Combined.tar.gz
- 文件格式:GZ压缩包
- 字段映射介绍:伏尔加河与梅拉米克河种群合并的基因组数据
- PopulationsLists.tar.gz
- 文件格式:GZ压缩包
- 字段映射介绍:种群列表相关数据
- Meramec.tar.gz
- 文件格式:GZ压缩包
- 字段映射介绍:非冰河区域梅拉米克河流域彩虹镖鲈种群基因组数据
- E.caeruleum-SampleID_LocalityID_MID.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含Sample ID(样本ID)、Location ID(地点ID)、Latitude, Longitude(经纬度)、Abbrev.(缩写)、Sex(性别)、MID(分子标识符)、MID sequence(分子标识符序列)、Illumina ID(测序ID)等样本元数据字段
适用场景
- 冰河历史对淡水鱼类种群遗传结构影响研究: 分析伏尔加河(冰河区域)与梅拉米克河(非冰河区域)种群的遗传差异及冰河消退后的扩张模式
- 河流景观基因组学分析: 探究河流网络结构与种群遗传多样性的关系,验证溪流层级模型适用性
- 种群遗传多样性分布研究: 基于样本元数据与基因组数据,分析不同环境下种群遗传多样性的空间分布特征
- 物种适应性进化研究: 结合冰河与非冰河环境数据,研究彩虹镖鲈对不同气候历史环境的适应性进化机制