数据集概述
本数据集为研究苏必利尔湖西部Coregonus artedi复合体生态辐射的多维度数据,包含形态测量、稳定同位素及转录组SNP数据,共5个文件。数据用于分析物种间形态、生态与基因组变异的一致性,探究低遗传分化下的生态差异及物种形成机制,为理解生物多样性起源提供支持。
文件详解
- README.docx
- 文件格式:DOCX
- 内容说明:数据集说明文档,提供研究背景、数据采集与处理方法、文件清单及使用指南
- Cisco-stable-isotope-data_final.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 内容说明:稳定同位素数据文件,记录样本的同位素比值等生态特征指标
- Cisco-snps-overlapping-orthos-reduced-dataset_NoCZ08.vcf
- 文件格式:VCF
- 内容说明:简化的SNP数据集(排除CZ08样本),基于重叠直系同源基因的转录组测序结果
- Cisco-samples-morphometrics_final.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 内容说明:形态测量数据文件,包含样本的形态学特征测量值
- Cisco-SNPs-allsamples.vcf
- 文件格式:VCF
- 内容说明:全样本SNP数据集,基于转录组测序的单核苷酸多态性数据
数据来源
论文“Concordant patterns of morphological, stable isotope, and genetic variation in a recent ecological radiation (Salmonidae:Coregonus spp.)”
适用场景
- 进化生物学研究:分析Coregonus物种生态辐射过程中形态、生态与遗传变异的关联模式
- 物种形成机制探究:研究低遗传分化下生态差异驱动的物种分化及不完全谱系分选现象
- 功能基因组分析:通过SNP数据识别与视觉、发育、代谢及免疫相关的差异基因
- 生态适应性研究:利用稳定同位素数据解析物种栖息地适应性及生态位分化特征
- 生物多样性起源分析:整合多维度数据揭示物种多样性形成的模式与过程