数据集概述
本数据集为人类与小鼠衰老和癌症表观遗传特征保守性研究的配套数据,包含研究中涉及的数据框、数据库、脚本及补充材料,共12个文件。通过简化代表性亚硫酸氢盐测序分析人类和小鼠年轻/年老、肿瘤/非肿瘤脑组织甲基化组,探究跨物种表观遗传模式的保守性及功能后果。
文件详解
- README.docx:DOCX格式,包含数据集说明文档
- 5_sdCpGs_list.zip:ZIP格式,标准差CpG位点列表
- 2_dmCpGs_lists.zip:ZIP格式,差异甲基化CpG位点列表
- 10_shiny_app.zip:ZIP格式,Shiny应用程序文件
- 0_code_instructions.zip:ZIP格式,代码说明文档
- 7_states_regionDB.zip:ZIP格式,状态区域数据库
- 3_pathway_enrichment_results.zip:ZIP格式,通路富集分析结果
- 9_gene_expression_analyses.zip:ZIP格式,基因表达分析数据
- 6_histones_regionDB.zip:ZIP格式,组蛋白区域数据库
数据来源
论文“Conservation of aging and cancer epigenetic signatures across human and mouse”
适用场景
- 表观遗传学研究:分析人类与小鼠衰老和癌症相关的DNA甲基化模式保守性
- 生物医学研究:探究衰老与癌症的表观遗传关联及跨物种功能保守性
- 基因组学分析:利用CpG位点列表、通路富集结果等开展甲基化组功能注释
- 数据可视化应用:通过Shiny应用程序实现表观遗传数据的交互式分析与展示
- 生物信息学方法验证:基于代码说明文档复现跨物种甲基化组比较分析流程