数据集概述
本数据集为多花梾木(Cornus florida L.)局部适应生态基因组研究成果,通过基因分型测序(GBS)技术分析美国北卡罗来纳州不同生态栖息地亚种群,检测受局部选择的基因位点及其与环境功能性状、疾病感染的关联,包含研究说明文档与表型环境协变量矩阵数据。
文件详解
- 文件名称:README_for_Pheno-Env_covariates_supermatrix_molecol_manu4-16-16.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:研究说明文档,包含实验设计、数据分析方法、样本信息及结果解释等内容
- 文件名称:Pheno-Env_covariates_supermatrix_molecol_manu4-16-16.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含样本顺序、样本ID、个体ID、种群ID、亚种群、测序批次、经度、纬度、近水距离、冠层覆盖度、HM、WV、pH、BS、Ac、CEC、P、K、Ca、Mg、S、Na等表型及环境协变量字段
数据来源
论文“Ecological genomics of local adaptation in Cornus florida L. by genotyping by sequencing”
适用场景
- 森林物种局部适应机制研究: 分析多花梾木受局部选择的基因位点与环境压力的关联
- 生态基因组学方法验证: 测试基因分型测序(GBS)技术在非模式物种局部适应研究中的应用效果
- 环境功能性状关联分析: 探究基因型与表型、环境因子(如钾含量、温湿度)的相关性
- 森林保护策略制定: 基于局部适应遗传基础为受真菌病害威胁的多花梾木提供保护依据