数据集概述
本数据集包含论文“Identification and validation of 174 COVID‑19 vaccine candidate epitopes reveals low performance of common epitope prediction tools”中使用的相关数据，主要涉及SARS-CoV-2疫苗候选表位的预测结果及表位预测工具的基准测试数据，为研究表位预测工具性能提供支持。
文件详解
- sars-cov-2_predicted.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含11种HLA等位基因（HLA-A0101、HLA-A0201、HLA-A0301、HLA-A1101、HLA-A2402、HLA-B4001、HLA-C0401、HLA-C0101、HLA-C0701、HLA-C0702、HLA-DRB10401），以及NetMHC套件工具预测为结合物的SARS-CoV-2肽段序列（如CTDDNALAY、FLAHIQWMV等），这些肽段经稳定性测定揭示为SARS-CoV-2表位。
- tools_predictions_binders.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含基准测试中所有测试工具的预测结果（注意不同工具使用的衡量标准不同），以及结合物（表位）列表，包含IEDB链接和与T细胞研究的重叠信息。
数据来源
论文“Identification and validation of 174 COVID‑19 vaccine candidate epitopes reveals low performance of common epitope prediction tools”
适用场景
- COVID-19疫苗候选表位研究: 分析经NetMHC套件工具预测的SARS-CoV-2肽段结合HLA等位基因的情况，筛选潜在疫苗候选表位。
- 表位预测工具性能评估: 基于不同工具的预测结果，评估常见表位预测工具的准确性和可靠性。
- 免疫表位数据库关联分析: 通过IEDB链接，整合现有免疫表位数据，深入研究表位的免疫原性。
- T细胞表位研究: 分析结合物列表与T细胞研究的重叠，探索表位激活T细胞免疫反应的潜力。
