数据集概述
本数据集为COVID-19住院易感性基因的整合基因组分析结果，包含全转录组关联研究（TWAS）、剪接转录组关联研究（spTWAS）、表型关联研究（PheWAS）及实验室指标关联研究（LabWAS）的完整结果，涉及基因表达、剪接与蛋白质丰度数据，聚焦炎症和凝血相关通路，共6个文件。
文件详解
- README_TWAS.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：多组织TWAS和spTWAS完整结果的说明文档，包含研究背景与结果概述
- Supplementary_Table_eQTL_SMetaXcan.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含ensembl（基因ENSEMBL ID）、Tissue（组织名称）、zscore（基因-组织关联z值）、pvalue（关联p值）、bonferroni（Bonferroni校正p值）等字段
- SupplementaryTable-spQTL_SMetaXcan.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：剪接QTL关联分析结果，推测包含基因剪接与组织的关联统计量（具体字段未完全展示）
- PheWAS_ALL_Results_.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含Predictor（预测因子）、phenotype（表型）、Gene（基因）、EA_beta（欧洲人群beta值）、EA_OR（欧洲人群OR值）、EA_p（欧洲人群p值）、AA_beta（非洲人群beta值）等表型关联字段
- Headers_Key_LabWAS_PheWAS_KS.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：LabWAS与PheWAS结果的表头说明文档，解释各字段定义
- LabWAS_ALL_Results.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含Lab（实验室指标）、Predictor（预测因子）、Gene（基因）、EA_p（欧洲人群p值）、EA_OR（欧洲人群OR值）、AA_p（非洲人群p值）、bonferroni（校正p值）等实验室指标关联字段
数据来源
论文“Integrative genomic analyses identify susceptibility genes underlying COVID-19 hospitalization”
适用场景
- COVID-19住院风险机制研究: 分析基因表达、剪接与住院易感性的关联，挖掘关键致病基因
- 炎症与凝血通路研究: 基于整合数据探索COVID-19相关的炎症和凝血通路分子机制
- 跨人群遗传关联分析: 对比欧洲（EA）与非洲（AA）人群的基因关联差异，研究遗传异质性
- 临床表型与实验室指标关联分析: 利用PheWAS和LabWAS结果，关联基因与临床表型、实验室指标的关系
- 转录组关联研究方法验证: 参考TWAS和spTWAS的分析结果，验证多组织转录组关联研究方法的应用价值
