数据集概述
本数据集是COVID-CDR平台的支撑数据资源，聚焦新冠病毒（SARS-CoV-2）感染的组合药物重定位及作用机制研究。通过网络分析方法整合药物、靶点、蛋白互作等多维度信息，为识别有效单药及协同药物组合提供系统性支持，包含药物信息、网络距离、通路富集、临床/细胞实验组合等16份结构化数据文件。
文件详解
- 药物基础信息类
- 文件名称：
All COVID-19 drugs and measures.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含COVID-19相关药物的治疗类别、适应症、批准状态、疾病 proximity 评分、功能 proximity 评分、功能相关性评分等核心属性
- 文件名称：
DrugBank-Sider_mapping.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：DrugBank药物数据库与Sider不良反应数据库的映射关系数据
- 网络分析类
- 文件名称：
Drug-SARS-COV2 shortest distance.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：COVID-19药物与SARS-CoV-2蛋白之间的网络最短距离数据
- 文件名称：
Pair-wise_Similarity_and_Network_Seperation_info.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：药物两两之间的相似性评分及网络分离度信息
- 文件名称：
SARS-COV_Human_PPI.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：SARS-CoV-2相关蛋白与人类蛋白的相互作用（PPI）网络数据
- 文件名称：
All_nodes_in_COVID-CDR.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：COVID-CDR平台中涉及的所有网络节点（药物、蛋白等）基础信息
- 药物组合类
- 文件名称：
COVID-19_Drug-combination_mode.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含Drug_ID1、DrugName1、DP_Drug1（疾病 proximity 评分）、FR_Drug1（功能相关性评分）、Drug_ID2、DrugName2、Net_Sep（网络分离度）等药物组合的量化评估指标
- 文件名称：
Combinations_in_Clinical_trials.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：已进入临床试验阶段的COVID-19药物组合信息
- 文件名称：
Combinations_experimented_in_various_cell-lines.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：在不同细胞系中开展实验验证的药物组合数据
- 通路与功能类
- 文件名称：
COVID-19_Drug-induced_pathways.rds
- 文件格式：RDS
- 字段映射介绍：COVID-19药物靶点在KEGG、Reactome等多数据库中的富集通路数据
- 文件名称：
Functional_Enrichment_of_human_disease_proteins.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：人类疾病相关蛋白的功能富集分析结果
- 说明文件类
- 文件名称：
ReadMe.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含所有数据文件的名称、描述、格式、大小等元信息
数据来源
COVID-CDR网络平台（http://vafaeelab.com/COVID19_repositioning.html）
适用场景
- 新冠药物重定位研究: 利用药物基础信息与网络距离数据，筛选潜在有效单药及协同药物组合
- 药物作用机制分析: 通过通路富集数据解析COVID-19药物的细胞分子作用机制
- 临床药物组合验证: 结合临床试验与细胞实验数据，评估药物组合的临床转化潜力
- 生物医药网络分析: 基于蛋白互作网络与药物相似性数据，构建新冠治疗的分子网络模型
- 药物研发决策支持: 为新冠治疗药物的组合策略制定提供数据支撑与机制解释
