数据集概述
本数据集围绕核心-边缘假说（CPH）展开，通过生态位模型结合当前与末次冰盛期气候数据，量化分析了林蛙（Lithobates sylvaticus）东部进化枝31个种群的遗传多样性，涵盖杂合度、等位基因丰富度及种群分化等指标，揭示历史生态适宜性对遗传多样性的关键影响。
文件详解
- 气候数据文件
- 文件名称：BioClim 2.5 clipped.zip、BioClim 30s clipped.zip、Paleo 2.5 clipped.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含当前气候（BioClim）和历史气候（Paleo）的栅格数据，用于构建生态适宜性模型
- 种群定位文件
- 文件名称：eastclade_locality.xls、Locality_East&West Clade.csv
- 文件格式：XLS、CSV
- 字段映射介绍：记录31个林蛙种群的地理坐标（纬度33°至45°）、采样地点等基础信息
- 遗传分析文件
- 文件名称：Genotype_data.xls
- 文件格式：XLS
- 字段映射介绍：包含12个多态微卫星标记的基因型数据，用于计算遗传多样性指标
- 遗传多样性矩阵文件
- 文件名称：cGD_matrix.csv、Linearized FST matrix.csv、resistance matrix.csv、Log_Euclidean Distance.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：记录种群间遗传多样性（cGD）、线性化遗传分化系数（FST）、抗性距离、欧氏距离等矩阵数据
- 种群分化矩阵文件
- 文件名称：cGD_matrix.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：记录种群间遗传多样性差异矩阵，用于分析种群分化模式
数据来源
论文“History matters more when explaining genetic diversity within the context of the core-periphery hypothesis”
适用场景
- 生态遗传学研究：分析林蛙种群遗传多样性分布规律，验证核心-边缘假说
- 气候适应性研究：结合历史与当前气候数据，探究气候变迁对物种遗传结构的影响
- 种群分化机制分析：通过遗传分化系数矩阵，揭示地理隔离与生态因子对种群分化的作用
- 保护生物学应用：识别遗传多样性热点区域，为林蛙物种保护策略制定提供科学依据
- 生态位模型构建：利用气候数据与种群分布信息，构建物种生态位模型并预测潜在分布区
