数据集概述
本数据集围绕墨西哥湾东部牡蛎(Crassostrea virginica)对低盐度环境的适应能力展开,通过两年野外移植实验与北卡罗来纳II育种设计,分析遗传变异与跨代可塑性对牡蛎幼体体型、存活率的影响,为该经济物种的低盐度耐受性育种提供依据。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称:README.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:数据集说明文档,包含实验背景、设计与结果概述
- 数据类文件
- 文件名称:family_means_v2.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含Animal(个体)、Family(家系)、L_Length(低盐度体长)、H_Length(中盐度体长)、Sire_Acclim(父本驯化盐度)、Dam_Acclim(母本驯化盐度)、Sire_ID(父本ID)、Dam_ID(母本ID)等字段
- 文件名称:oyster_ped_covar_matrix.txt、oyster_size_eggQual.txt、oyster_size-2.txt、cumulative_parent_mort.txt、oyster_mortality.txt、parent_mort.txt等10个TXT文件
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含牡蛎系谱协方差矩阵、体型与卵质数据、亲本累计死亡率、幼体死亡率等原始观测数据
- 代码类文件
- 文件名称:parent_mort.R、Genetic_coVariation.R、Oyster_MCMCglmm.R、Oyster_mortality_ANOVA.R等6个R文件
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:用于亲本死亡率分析、遗传协方差计算、混合线性模型分析、死亡率方差分析的脚本文件
数据来源
论文“Transgenerational plasticity and the capacity to adapt to low salinity in the eastern oyster, Crassostrea virginica”
适用场景
- 海洋生物适应性研究:分析东部牡蛎对低盐度环境的遗传适应与跨代可塑性机制
- 水产育种应用:基于遗传变异数据指导牡蛎低盐度耐受性品种选育
- 气候变化生态学研究:评估牡蛎应对未来盐度下降的进化潜力
- 数量遗传学分析:利用遗传参数(如遗传力)研究牡蛎体型等性状的遗传结构