数据集概述
本数据集来自日本重要经济林木日本柳杉的基因组扫描研究,针对14个自然种群的1026个基因座,通过多方法检测筛选出与环境梯度相关的适应性候选基因,分析基因型与环境变量的关联及连锁群分布特征,识别出连锁群11为分化基因组岛,为保护和分子育种提供基础数据。
文件详解
- 文件名称:CJ_geno_1026SNP.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含日本柳杉14个自然种群1026个SNP基因座的基因型数据,支持环境变量与基因型关联分析、连锁群定位及适应性基因筛选等研究。
数据来源
论文“Genome scanning for detecting adaptive genes along environmental gradients in the Japanese conifer, Cryptomeria japonica”
适用场景
- 林木适应性进化研究:分析日本柳杉种群对环境梯度的适应性基因分化机制
- 分子育种应用:筛选高显著性的适应性基因位点,为日本柳杉分子育种提供靶点
- 物种保护策略制定:基于适应性基因分布特征,优化日本柳杉自然种群保护方案
- 基因组岛研究:探究连锁群11作为分化基因组岛的结构与功能特征
- 环境关联分析:研究基因型与年均温、日最高温、最大积雪深度等环境变量的关联模式