数据集概述
本数据集为晶体结构预测(CSP)方法中分子内能量函数的优化研究数据,包含自适应局部近似模型(LAM)的应用案例。通过苯甲酸、ROY分子及第六次盲测分子XXVI的能量计算与晶体结构预测,验证了LAM方法在平衡计算精度与成本上的优势,可支持大柔性分子的高效CSP研究。
文件详解
- 分子结构文件(.zmt格式)
- 文件名称:benzoic_acid.zmt、ROY.zmt、Molecule_26.zmt
- 文件格式:ZMT
- 字段映射介绍:存储苯甲酸、ROY分子及第六次盲测分子XXVI的三维结构信息,为能量计算提供分子构型基础
- LAM点位数据文件(.txt格式)
- 文件名称:ROY_uniform_lams.txt、ROY_non_uniform_lams.txt、benzoic_acid_LAM_points.txt、MOL26_LAM_points.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:记录不同分子在均匀/非均匀网格下的局部近似模型(LAM)点位坐标,支持能量函数的自适应优化
- 图表数据文件(.xlsx格式)
- 文件名称:graph_data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:存储能量计算结果的可视化图表数据,用于分析LAM方法的精度与成本平衡效果
- 排名结果文件(.res格式)
- 文件名称:ranked_list.res
- 文件格式:RES
- 字段映射介绍:包含晶体结构预测的结果排名信息,验证分子XXVI实验晶型的全局最小能量预测
数据来源
论文“Accurate and efficient representation of intramolecular energy in ab initio generation of crystal structures. Part I: Adaptive local approximate models”
适用场景
- 计算化学能量模型优化:分析自适应局部近似模型(LAM)在分子内能量计算中的精度与效率
- 晶体结构预测方法改进:验证LAM方法对大柔性分子(如ROY、分子XXVI)的CSP性能提升效果
- 分子构型与能量关系研究:通过LAM点位数据探究分子构象变化与能量分布的关联
- 计算成本优化分析:对比均匀/非均匀LAM网格在平衡计算精度与资源消耗上的差异
- 盲测分子结构预测验证:支持第六次盲测分子XXVI的晶体结构预测结果复现与评估