数据集概述
本数据集围绕翠鸟（Alcedinidae）羽毛颜色模式演化研究构建，采用历史生物地理学模型工具，分析羽毛颜色斑块距离、演化速率及机制差异，验证生物地理学方法在复杂表型建模中的适用性，包含数据文件、代码脚本、补充文档及视频等16个文件。
文件详解
该数据集包含16个文件，按类型分类说明如下：
- 生物地理学数据文件（.nex格式，6个）：
- king_co.nex、king_sr.nex、king_e.nex、king_w.nex、king_sb.nex、king_p.nex：可能为用于历史生物地理学分析的NEXUS格式数据文件，包含翠鸟羽毛颜色演化相关的系统发育或地理数据
- 代码文件（.R格式，2个）：
- plotBird.R：用于绘制翠鸟相关可视化结果的R脚本
- utility_functions.R：包含数据分析所需辅助函数的R脚本
- 结构化数据文件（.csv格式，2个）：
- interpatch_dist.csv：记录翠鸟羽毛颜色斑块间距离数据，字段含物种名、光谱距离（distSpectro）、扩散距离（distSpread）等
- catnums.csv：记录标本信息，字段含学名（Scientific name）、机构（Institution）、标本编号（Catalog number）
- 文档与补充材料（.pdf、.mp4格式，3个）：
- Eliason_plumage_supp_accepted.pdf、Eliason_plumage_supp_accepted_r1.pdf：研究补充文档，可能包含方法细节、结果补充等
- plumage_supp_video1.mp4：羽毛相关补充视频材料
- 其他数据与配置文件（.rev、.txt、.zip格式，3个）：
- p_dec_dist_noclado_folded.rev：可能为模型参数配置文件
- atlas_folded.txt：结构化文本文件，包含羽毛相关的时空或区域数据（如纬度、经度信息）
- ancestral_reconstructions.zip：压缩文件，可能包含祖先状态重建结果数据
适用场景
- 鸟类宏观演化研究：分析翠鸟羽毛颜色模式的演化速率、机制差异及地理分布规律
- 生物地理学方法应用：验证历史生物地理学模型在复杂表型（如羽毛颜色）演化建模中的适用性
- 表型多样性驱动因素研究：探究发育与选择压力对翠鸟羽毛颜色多样性的影响
- 跨学科方法拓展：将生物地理学工具应用于其他复杂表型（如寄生虫体表演化）的建模研究
- 鸟类标本数据整合分析：结合标本编号与机构信息，开展基于馆藏标本的羽毛特征验证研究
