数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了CX10菌株(osm-9(ky10)IV)成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基上的行为实验数据。实验由Schafer实验室完成,采用tierpsy软件追踪分析,包含视频处理后的特征数据和运动轨迹数据,总计3个文件。
文件详解
- 文件名称:
osm-9 (ky10) on food L_2010_06_15__14_54_50___1___8.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩文件,可能包含线虫行为轨迹的标准格式数据
- 文件名称:
osm-9 (ky10) on food L_2010_06_15__14_54_50___1___8_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,可能包含运动速度、身体弯曲度、头部摆动频率等量化指标
- 文件名称:
osm-9 (ky10) on food L_2010_06_15__14_54_50___1___8.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验原始追踪数据,包含19224个分割骨架数据,对应899.543秒实验时长、每秒25.8398帧的视频解析结果
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析osm-9基因对秀丽隐杆线虫觅食、运动等行为的调控作用
- 神经生物学实验验证: 验证osm-9基因在感知环境刺激中的功能机制
- 行为学实验方法优化: 基于标准化实验流程(E. Yemini等方法)改进线虫行为实验设计
- 生物图像分析算法评估: 利用已知行为数据测试tierpsy等线虫追踪软件的准确性
- 模式生物行为数据库补充: 为秀丽隐杆线虫行为数据库提供标准化的基因功能实验数据