数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)syg-2(ky671)X突变株(品系CX6391)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在NGM低蛋白胨培养基、OP50食物条件下的行为特征,包含视频追踪数据及提取的行为特征,可用于研究syg-2基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为特征文件:
- 文件名称:syg-2 (ky671)X on food R_2010_07_22__15_43_44112_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含运动轨迹、骨架信息等量化指标
- 行为数据压缩文件:
- 文件名称:syg-2 (ky671)X on food R_2010_07_22__15_43_44112.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储线虫行为数据(wcon格式),包含行为事件、运动参数等结构化信息
- 追踪数据文件:
- 文件名称:syg-2 (ky671)X on food R_2010_07_22__15_43_44112.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储视频追踪原始数据,包含26743个分割骨架信息,关联视频像素与实际长度(4.36527微米/像素)、帧率(30.03帧/秒)等参数
数据来源
C.elegans behavioural database
适用场景
- 线虫遗传学研究:分析syg-2基因对秀丽隐杆线虫运动行为、觅食行为的调控机制
- 行为表型分析:基于视频追踪数据量化突变株与野生型线虫的行为差异
- 基因功能验证:验证syg-2基因在神经系统发育或行为调控中的作用
- 实验方法复现:参考E. Yemini等人的实验方法,开展同类线虫行为实验设计