数据集概述
本数据集为淡水贻贝属Cyprogenia物种界定研究的遗传数据,包含223个样本的10个微卫星位点数据与线粒体ND1基因序列数据。研究通过对比线粒体与核基因数据的不一致性,分析其对物种界定的影响,涉及样本信息、基因分型及DNA序列等内容,共包含4个文件。
文件详解
- 文件名称:README_for_Cyprogenia_Sample.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含145个Cyprogenia aberti与53个Cyprogenia stegaria样本的采样信息,涉及样本ID、基于现有分类的物种名称(密西西比河东西侧的分类)、阿肯色州立大学博物馆凭证号、GenBank登录号等内容。
- 文件名称:Cyprogenia_Sample.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:推测为样本相关的详细数据,可能包含采样位置、样本基本属性等信息。
- 文件名称:Cyprogenia_Genotyping.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:推测为微卫星基因分型数据,包含223个样本在10个微卫星位点的基因型信息。
- 文件名称:Cyprogenia_DNAseq.nex.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:包含线粒体ND1基因的序列数据,用于系统发育分析等研究。
数据来源
论文“Incongruence between mtDNA and nuclear data in the freshwater mussel genus Cyprogenia (Bivalvia: Unionidae) and its impact on species delineation”
适用场景
- 淡水贻贝物种界定研究: 对比线粒体与核基因数据,分析物种分类的合理性及遗传标记的影响。
- 遗传多样性分析: 利用微卫星位点数据研究Cyprogenia属种群的遗传结构与多样性。
- 分子系统发育研究: 通过线粒体ND1基因序列数据探讨物种间的进化关系。
- 保护生物学应用: 为北美淡水贻贝这一濒危类群的保护策略制定提供遗传数据支持。