数据集概述
本数据集包含用于计算蛋白质-蛋白质结合亲和力的混合引导分子动力学（hSMD）相关资源，包括C++代码、NAMD2.13软件二进制文件及复现相关研究论文结果所需的参数、坐标、结构和脚本。
文件详解
- 文件名称: namd2.13hSMDexampleRas-RalGDS.tar.gz，文件格式: .gz，内容: 可能包含Ras-RalGDS蛋白体系的hSMD示例数据，用于复现论文结果
- 文件名称: namd2.13with-hSMD-cuda-singlenode-x86_64.tar.gz，文件格式: .gz，内容: 适用于Linux工作站CUDA环境的NAMD2.13含hSMD功能的二进制文件
- 文件名称: namd2.13hSMD-C++code-scripts.tar.gz，文件格式: .gz，内容: hSMD的C++源代码及相关脚本文件
适用场景
- 计算生物学研究: 用于复现蛋白质-蛋白质结合亲和力的hSMD模拟研究
- 分子动力学模拟: 提供含hSMD功能的NAMD软件及示例数据，支持相关模拟实验
- 生物物理研究: 分析蛋白质相互作用的能量特征及结合机制
- 计算方法验证: 验证hSMD方法在蛋白质-蛋白质亲和力预测中的应用效果
