数据集概述
本数据集记录了对蛋白质序列比对方法的评估研究结果，重点对比统计共估计方法BAli-Phy与其他流行比对方法在模拟及生物基准数据集上的性能，分析其精度、召回率差异及潜在影响因素。
文件详解
- 文件名称: S2-supplementary_information_spreadsheet_v5_resubmission.xlsx：Excel格式，可能包含研究的补充数据，如各比对方法在不同数据集上的具体性能指标（精度、召回率等）。
- 文件名称: revision-systematic-biology-supplement.pdf：PDF格式，可能包含研究的补充说明文档，如实验设计细节、结果讨论或方法学补充。
- 文件名称: data_for_dryad.zip：压缩包格式，可能包含研究中使用的原始或处理后的蛋白质序列数据集（如1192个生物基准数据集及120个模拟数据集）。
适用场景
- 生物信息学方法研究：分析不同蛋白质序列比对方法的性能差异，优化算法选择。
- 进化生物学研究：评估统计共估计方法在系统发育树构建中的适用性。
- 计算生物学模型验证：探究模型误设、参考比对误差等因素对序列比对结果的影响。
- 蛋白质组学应用：为蛋白质结构预测、家族鉴定等下游分析提供比对方法选择依据。
