淡水污染物适应性基因组特征数据集

数据集概述

本数据集围绕两种大型无脊椎动物对淡水污染物的局部适应基因组特征展开,包含Glossosoma conformis基因组预测的基因集、功能注释、核RNA数据,以及两种生物过滤后的种群遗传学分析数据集,为研究污染物适应机制提供数据支持。

文件详解

  • 压缩文件:
  • Geneset.zip: 压缩文件,包含Glossosoma conformis基因组预测的基因集相关文件,包括基因汇总信息表(.gff)、mRNA序列(.cds)、蛋白质序列(.pep)
  • Functional annotation.zip: 压缩文件,包含Glossosoma conformis基因集的功能注释文件,基于KEGG、NCBI非冗余蛋白序列、Swiss-Prot、TrEMBL、InterPro等数据库的注释结果
  • nuclear RNA.zip: 压缩文件,包含Glossosoma conformis基因组中的核RNA序列文件,涵盖tRNA、miRNA、snRNA、rRNA等类型的RNA数据
  • 种群数据集:
  • Dugesia gonocephala.pop: 种群遗传学和选择测试用的最终过滤数据集
  • Glossosoma conformis.pop: 种群遗传学和选择测试用的最终过滤数据集

适用场景

  • 基因组学研究: 分析淡水无脊椎动物基因结构、功能注释及核RNA组成
  • 环境适应性研究: 探究污染物胁迫下生物局部适应的基因组机制
  • 种群遗传学分析: 开展两种无脊椎动物的种群遗传结构及选择压力检测
  • 分子生态学研究: 揭示淡水生态系统中生物对环境污染的响应策略
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 13.78 MiB
最后更新 2025年11月27日
创建于 2025年11月27日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。