单药治疗药物反应预测跨研究基准数据集

数据集概述

该数据集为单药治疗药物反应预测的跨研究基准数据，整合了细胞系药物反应、多组学、药物特征及建模分区数据。数据源于五个药理基因组学研究，经统一流程处理，包含药物反应指标、细胞系多组学信息、药物分子特征及训练验证测试分区文件。

文件详解

• 文件名称: csa_data.zip：压缩包格式，包含四类核心数据
• 细胞系药物反应数据：来自CCLE、CTRPv2等五研究，含AUC、IC50等剂量独立反应指标
• 细胞系多组学数据：源于DepMap门户，含基因表达、DNA突变等多组学类型
• 药物特征数据：基于PubChem的SMILES字符串，由Mordred和RDKit计算分子指纹与描述符
• 数据分区文件：由IMPROVE基准流程生成，定义模型训练、验证、测试样本划分

适用场景

• 药物反应预测模型训练与评估
• 跨数据集泛化能力分析研究
• 多组学数据与药物特征关联挖掘
• 药理基因组学领域基准测试开发