数据集概述
本数据集包含大型溞微生物组的宏基因组组装及宏基因组组装基因组数据，涵盖六个样本的单独组装、混合组装结果，以及通过两种工具生成的宏基因组组装基因组，同时包含其分类鉴定与质量检测结果，为研究大型溞微生物组提供基础数据支持。
文件详解
- 宏基因组组装文件
- 文件名称：metagenome_assemblies.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含六个样本（G4、G14、S1-S4）的单独组装结果及混合组装结果（a_assembly），由SPAdes v3.14的metaSPAdes工具生成
- VAMB生成的宏基因组组装基因组文件
- 文件名称：vamb_bins.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：通过VAMB v3.0.2工具生成的宏基因组组装基因组
- ProxiMeta生成的宏基因组组装基因组文件
- 文件名称：proximeta_bins.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：通过ProxiMeta工具生成的宏基因组组装基因组
- VAMB生成基因组的分类鉴定结果文件
- 文件名称：vamb_gtdbtk.tsv
- 文件格式：TSV
- 字段映射介绍：包含user_genome、classification、fastani_reference等字段，记录由GTDB-Tk v1.3工具得到的分类鉴定结果
- VAMB生成基因组的质量检测结果文件
- 文件名称：vamb_checkm.tab
- 文件格式：TAB
- 字段映射介绍：记录由CheckM v1.1工具对VAMB生成基因组的质量检测结果
- ProxiMeta生成基因组的分类鉴定结果文件
- 文件名称：proximeta_gtdbtk.tsv
- 文件格式：TSV
- 字段映射介绍：包含user_genome、classification、fastani_reference等字段，记录由GTDB-Tk v1.3工具得到的分类鉴定结果
- ProxiMeta生成基因组的质量检测结果文件
- 文件名称：proximeta_checkm.tab
- 文件格式：TAB
- 字段映射介绍：记录由CheckM v1.1工具对ProxiMeta生成基因组的质量检测结果
- 补充表格文件
- 文件名称：daphnia_magna_metagenome_resource_announcement_supptable1.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：大型溞宏基因组资源公告的补充表格
适用场景
- 微生物组结构分析：用于研究大型溞微生物组的物种组成与丰度分布
- 宏基因组组装方法比较：分析不同组装工具（metaSPAdes、VAMB、ProxiMeta）的组装效果差异
- 微生物基因组功能研究：基于宏基因组组装基因组数据挖掘微生物功能基因
- 微生物分类鉴定研究：利用GTDB-Tk的分类结果开展微生物分类学分析
- 基因组质量评估研究：通过CheckM的检测结果分析宏基因组组装基因组的质量特征
