数据集概述
本数据集包含大型溞(Daphnia magna)暴露于两种短链PFAS(PFBS和FBSA)的六代多世代研究原始数据及R分析脚本。原始数据涵盖急性毒性测试中的活动度、多世代测试的成体存活、繁殖、种群增长率、暴露浓度、体内浓度及生物累积因子等指标,遵循经修改的OECD测试指南,支持PFAS对水生生物长期影响的分析。
文件详解
- 数据文件
- 文件名称:
Raw_toxicity_data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:含4个工作表:
- "Acute tests":急性毒性数据,字段包括Conc_nominal(标称浓度)、Mobility(活动度)、Compound(化合物类型)
- "Chronic tests (Survival)":多世代存活数据,字段包括Conc_nominal(标称浓度)、Conc_measured(实测浓度)、Intern_conc(体内浓度)、Survival(存活率)、Gen(世代)、Compound(化合物类型)
- "Chronic tests (Repro & r)":多世代繁殖与种群增长数据,字段包括Conc_nominal(标称浓度)、Conc_measured(实测浓度)、Intern_conc(体内浓度)、Reproduction(繁殖量)、r(种群增长率)、Gen(世代)、Compound(化合物类型)
- "BAFs":生物累积因子数据,字段包括Conc_measured(实测浓度)、Intern_conc(体内浓度)、BAFs(生物累积因子)、Gen(世代)、Compound(化合物类型)
- R脚本文件
- 文件名称:
(Exposure) Dose-response curves.R
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:基于实测暴露浓度拟合毒性数据剂量-反应曲线的脚本
- 文件名称:
(Internal) Dose-response curves.R
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:基于体内PFAS浓度拟合毒性数据剂量-反应曲线的脚本
- 文件名称:
Data wrangling for plots.R
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:整理模型拟合结果与原始数据点以生成图表的脚本
- 文件名称:
Plotting dose-response curves.R
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:绘制拟合剂量-反应曲线的脚本
- 文件名称:
Bioaccumulation factors.R
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:拟合体内与实测暴露浓度的线性回归、绘制回归曲线及各世代生物累积因子的脚本
数据来源
荷兰科学研究组织(NWO)开放技术项目(项目编号18725)
适用场景
- 生态毒理学研究:分析短链PFAS对大型溞多世代存活、繁殖及种群增长的长期毒性效应
- PFAS生物累积研究:基于体内浓度与暴露浓度数据,探究短链PFAS在水生生物体内的累积规律
- 剂量-反应关系分析:利用R脚本拟合暴露/体内浓度与毒性终点的剂量-反应曲线,量化毒性阈值
- 环境风险评估:支持短链PFAS对水生生态系统长期影响的风险评估模型构建
- 毒理学方法优化:基于经修改的OECD测试指南数据,优化多世代毒理学测试方案